昭和31年9月10日、魚津大火により金屋町鎮座の「稲荷社」、村木町鎮座の「火之宮社」、金浦町鎮座の「杵築社(きつきしゃ)」、新金屋町鎮座の「市姫社」が火災にあい、救出された御神体が神明宮に合併合祀されました。
その後、昭和40年5月新社殿が再建されました。また、昭和41年大町小学校（廃校）改築の際、校庭にあった愛宕社を魚津神社へ遷座しました。
平成14年には魚津神社御鎮座1300年をむかえて盛大な奉祝記念大祭を執行し、記念事業として、社殿・神輿の改修及び氏子会館参集殿の建設が行われました。
現在の神紋「五つ巴紋(ともえもん)」は、再建により五社を合併したことを表しており、魚津神社独自ものです。

主祭神…天照皇太神（あまてらすおおみかみ）　元は神明社で祀ります。
相殿神…建御名方命（たけみなかたのみこと）　元は神明社で祀ります。
　　　　蒼稲魂命（うかのみたまのみこと）　元は稲荷社で祀ります。
　　　　彦火火出見命（ひこほほでみのみこと）元は火之宮社で祀ります。
　　　　素盞鳴命（すさのおのみこと）　元は杵築社で祀ります。
　　　　大市比売命（おおいちひめのみこと）　元は市姫社で祀ります。
　　　　建速須佐之男命（たけはやすさのおのみこと）　元は旧魚津城の鬼門除けの守護神
　　　　櫛名田比売命（くしなだひめのみこと）　元は旧魚津城の鬼門除けの守護神
　　　　菅原大神（菅原道真公）　加賀藩主、前田紀綱が勧請(かんじょう)
（※勧請…神仏の分身・分霊を他の地に移して祭ること）

境内にある愛宕社の火祭りが1月26日に、お焚きあげが7月24日に行われます。
春季例大祭（6月4日～6日）では4日に巡行が行われ馬が神輿を先導します。
烏帽子を被った宮司が、馬にまたがり車道を歩く姿はタイムスリップしてきたようで面白いです。